空間產(chǎn)品
通過采用尖端的空間技術(shù)，能夠在保持細(xì)胞原始空間位置的同時(shí)，精確分析和可視化基因表達(dá)和蛋白標(biāo)記等，深入研究組織微環(huán)境中的細(xì)胞互作。
10x Genomics空間轉(zhuǎn)錄組（含Visium HD）
將基因空間表達(dá)可視化，在識(shí)別不同細(xì)胞群的同時(shí)保留空間背景，提供了關(guān)于組織微環(huán)境中細(xì)胞功能、表型和位置關(guān)系的關(guān)鍵信息。
Stereo-seq空間轉(zhuǎn)錄組
該技術(shù)通過時(shí)空芯片捕獲組織中的 mRNA，并通過空間條形碼（Coordinate ID，CID）還原回空間位置實(shí)現(xiàn)組織原位測(cè)序，為深入地了解細(xì)胞的基因表達(dá)及形態(tài)與局部環(huán)境之間的關(guān)系建立強(qiáng)大的研究基礎(chǔ)。
Akoya空間蛋白組
可提供同時(shí)檢測(cè)幾種（PhenoImager Fusion）到100多種（PhenoCycler-Fusion）生物蛋白標(biāo)志物的解決方案，準(zhǔn)確定位細(xì)胞空間分布、判斷細(xì)胞行為、識(shí)別不同的細(xì)胞聚集模式，實(shí)現(xiàn)組織原位超多靶點(diǎn)蛋白標(biāo)記分析。
應(yīng)用方向
- 腫瘤及免疫研究：有助于識(shí)別腫瘤微環(huán)境中的細(xì)胞相互作用，以及免疫細(xì)胞在腫瘤進(jìn)展和治療反應(yīng)中的角色；
- 病理學(xué)研究：通過在組織切片上進(jìn)行高分辨率的分子表達(dá)分析，有助于揭示疾病的分子機(jī)制和組織中的病理變化；
- 發(fā)育生物學(xué)：通過分析發(fā)育過程中細(xì)胞在空間上的分布和基因表達(dá)變化，揭示細(xì)胞分化和組織形態(tài)形成的動(dòng)態(tài)過程；
- 空間圖譜：構(gòu)建器官和組織的空間圖譜，展示細(xì)胞在特定生理和病理狀態(tài)下的空間分布和相互作用，這對(duì)于理解復(fù)雜生物系統(tǒng)的結(jié)構(gòu)和功能至關(guān)重要；
- 生物標(biāo)志物挖掘：通過分析細(xì)胞在特定組織環(huán)境中的表達(dá)模式，可以識(shí)別與疾病進(jìn)程、治療響應(yīng)或預(yù)后相關(guān)的關(guān)鍵分子標(biāo)志物；
案例解析
頭頸部鱗狀細(xì)胞癌(HNSCC)腫瘤微環(huán)境空間激活途徑
單細(xì)胞聯(lián)合空間轉(zhuǎn)錄組揭示頭頸鱗狀細(xì)胞癌腫瘤微環(huán)境中增殖型耗竭CD8+T細(xì)胞作用
該研究利用單細(xì)胞水平的多組學(xué)技術(shù)構(gòu)建了人頭頸鱗狀細(xì)胞癌的多維度腫瘤微環(huán)境圖譜，從中鑒定出了一群具有增殖潛能并能持續(xù)發(fā)揮抗瘤效應(yīng)的新增殖型耗竭CD8+T細(xì)胞，并深入解析了其在腫瘤微環(huán)境中的作用機(jī)制。本研究系統(tǒng)性地解析了頭頸鱗狀細(xì)胞癌微環(huán)境中增殖型耗蝎CDB+T細(xì)胞的多維度特征，證實(shí)了其豐度與HPV陽(yáng)性頭頸鮮狀細(xì)胞癌患者預(yù)后間的關(guān)聯(lián)性，以耗竭CD8+T細(xì)胞異質(zhì)性為切入點(diǎn)，為HPV感染狀態(tài)如何影響CDK4抑制劑對(duì)頭頸鮮狀細(xì)胞癌的療效提供了新的解釋，有助于推動(dòng)頭頸鮮狀細(xì)胞癌精準(zhǔn)治療的進(jìn)一步發(fā)展。
參考文獻(xiàn)：Cheng D, Qiu K,Rao Y. et al. Proliferative exhausted CD8+ T cells exacerbate long-lasting anti-tumor effects in human papillomavirus-positive head and neck squamous cell carcinoma [J]. Elife. 2023 Feb 22:12:e82705.
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